我想可能有以下幾個原因吧
第一，海關(guān)為了方便管理，企業(yè)如果都自理報關(guān)，那樣向海關(guān)遞交的單證由于報關(guān)員水平參差不齊就會出現(xiàn)各種各樣的錯誤，增加海關(guān)審核單證的時間和難度。設(shè)立代理報關(guān)公司后海關(guān)可以統(tǒng)一代理報關(guān)規(guī)范，方便管理。
第二，代理報關(guān)公司有審核企業(yè)單證的義務(wù)，拒絕為提交不真實單證的企業(yè)提供服務(wù)，杜絕了一部分利用假單證瞞報、低保、漏報等情況的發(fā)生。
第三，很多企業(yè)距離海關(guān)非常遠，代理公司一般都在海關(guān)附近，在處理海關(guān)問題上比較有時間優(yōu)勢，只需要壹份長期的委托即可。
第四，企業(yè)報關(guān)是海關(guān)是要收取報關(guān)費用的，海關(guān)預錄入中心和代理公司之間是不需要票結(jié)的，如果是企業(yè)自理報關(guān)，那樣買報關(guān)單，報關(guān)委托書，交預錄費等就給海關(guān)增加了很大一塊工作量，同時也影響了清關(guān)速度。
第五，海關(guān)通關(guān)大廳是窗口式的，及時個別自理報關(guān)的企業(yè)網(wǎng)上發(fā)送數(shù)據(jù)后也要到現(xiàn)場遞交紙質(zhì)單據(jù)，如果都是企業(yè)的報關(guān)員的話，報關(guān)大廳的隊伍不會比火車站的隊伍差多少。
可能還有其他原因，以上這些不一定準確，屬于個人分析的。